В начале сентября 2014 года Фонд свободы информации обжаловал в Московском районном суде представление прокуратуры, по которому фонд должен зарегистрироваться как «иностранный агент». Суд оставил заявление без удовлетворения, и теперь юристы организации подготовили апелляционную жалобу в городской суд.

«Решение суда первой инстанции… основано на выводе суда о том, что фондом осуществлялась политическая деятельность, вследствие чего требования прокурора о направлении фондом заявление в Минюст России на включение организации в реестр организаций, выполняющих функции иностранных агентов, является законным и обоснованным. Однако полагаем, что суд первой инстанции необоснованно пришел к выводу о наличии в деятельности фонда признаков политической деятельности», — говорится в апелляционной жалобе.

Представление прокуратуры Фонд свободы информации получил 27 января 2014 года. До этого ведомство проверило организацию после «обращения заинтересованного гражданина». В результате прокуратура решило, что фонд, получая иностранное финансирование, занимается деятельностью, «являющейся инструментом формирования общественного мнения», т. е. по сути политической.

29 августа Минюст включило фонд в список «иностранных агентов». После этого председатель совета фонда Иван Павлов, чья супруга Джениффер Гаспар, гражданка США, в августе была выдворена из России за «создание угрозы национальной безопасности», заявил, что Институт развития свободы информации будет существовать в новом формате.