Для предупреждения угрозы наводнений Дирекция КЗС использует специально разработанную Систему предупреждения угрозы наводнений (СПУН), которая прогнозирует изменения уровня воды в Неве на 48 часов вперед. Благодаря СПУН, начиная с 24 ноября, поступала информация о возможном подъеме уровня воды выше 160 см.
28 ноября Дирекцией КЗС совместно с Управлением МЧС по Санкт-Петербургу было принято решение о закрытии затворов Комплекса защитных сооружений. Одновременно с прогнозом подъема воды система выдала план маневрирования затворами КЗС для предотвращения наводнения.
Оперативно принятые меры не позволили «высокой воде» проникнуть в Санкт-Петербург. Пик подтопления пришелся на 6-00 28 ноября и по фронту дамб составил +190 см выше ординара, что могло привести к подъему уровня Невы в районе Горного института до +220 — +230 см.
Благодаря работе Комплекса защитных сооружений, подъем воды в Санкт-Петербурге не превысил +128 см. 28 ноября при получении информации, что угроза миновала, и уровень воды понижается в Финском заливе в 9:40 было начато открытие затворов КЗС и в 11:50 сооружения были полностью открыты.
В настоящее время готовность КЗС позволила осуществить главную функцию — предотвращения наводнений в Санкт-Петербурге. Предварительный расчет предотвращенного ущерба — 1,3 млрд. руб.
На селекторном совещании Национального центра управления кризисными ситуациями МЧС России слаженная работа ФКП КЗС и Петербургского управления МЧС получила высокую оценку. Комплекс защитных сооружений Санкт-Петербурга от наводнений находится на постоянном дежурстве и полностью готов к работе при любой угрозе наводнения.